>Top 2. The bundle of institutions and multiple feedback:
- The view of life brought by the human genome:
- Humans have about 3 billion genomes.
- Late 1990s: Celera Corp. (John Craig Venter, president) raised several ten billion dollars and led the competition for decoding the human genome.
- If the genome was known, it was overstated that all human beings could be understood to collect research funds.
- However, it was revealed that it revealed the DNA sequence only, which is far from elucidating the principle of life.
- Gene duplication hypothesis:
- The number of protein information which the genes have is about 4,000 for E. coli, and about 30,000 for mice and humans
- As the number of genes increases, the genes similar to the existing ones are duplicated, (Gene duplication)
- >Top Housekeeping genes:
- Genes that have functions related to basic metabolism and replication of life resembles maintaining a house, whose number is estimated around 4,000 to 6,000. Two sets of these exist in nematodes, and four sets may be in vertebrates.
- If the genes are duplicated, there will be not problem even if one of them is mutated.
- In addition, it becomes easier to create complex new structures, and the speed of evolution of living things can be dramatically faster.
- >Top Increasing regulatory mechanism:
- In the case of human genome, the region where the structure of proteins is written about 2% of the total; most of the rest are the sequences related regulatory mechanism how to determine the utilization of proteins.
- This regulatory mechanism can steadily expand adaptability to the changing environment. (Neo-Darwinism incorrectly states that genes are selected as a choice.)
- Eg.: Red blood cell with abnormal hemoglobin are resistant to malaria infection.(Preadaptation to various changing environments)
- >Top Reverse Genetics:
- In the past, identification of proteins which are involved in the function of life has been important. Recherches were processed in the order of; from function to protein, then find the genes. (Forward genetics)
- Reverse genetics analyzed hereditary disease, finding particular proteins, then clarify the function.
- There are over 3,000 types of hereditary disease in humans.
- If one genetic change expresses the diseases, it is rather easier to find it. But in reality, multiple genes are often involved.
- Eg.: In the case of arteriosclerosis, persons with high cholesterol and high blood pressure, fat body, and smokers are ten times more likely to develop arteriosclerosis. (Linkage study)
- However, the linkage study does not prove a direct hypothesis, which needs to be statistical investigated. (Mega study)
- Such linkage studies have limits. There is a group of HLA (Human Leukocyte Antigen) genes which identify individuals in human immunity. Whether it is more convenient to marry a partner with different HLA to avoid consanguineous marriage has not yet definitive conclusion. The discussions of so-called love genes, or homosexual genes could be similar runaways.
- >Top Market economy has evolved with regulatory controls:
- The neoclassical general equilibrium model eliminated complex non-market institutions as much as possible. It has been regarded as the universal model which can apply to any country or society.
- But the facts are deferent; rather, non-market institutions excluded from the model actually controls the market economy. (The market is composed of a bunch of systems.)
- Unlike hitherto feudal system, the capitalist market economy has developed private property right as well as credit system including legal protection of lending relationships. However, in early days of the market economy, families and communities functioned as an essential premise. They have served as a pool for the unemployed and elderly people.
- Conversely, the more the market dismantles functions of families and communities, the more complex regulatory mechanisms are needed. Without such social security systems as labor unions, unemployment insurance, pensions and health insurance, our society cannot be maintained.
- Furthermore, deterioration of income distribution worsens the security of society, reduces consumption, and exacerbates the recession. Various income redistribution systems such as tax system and income subsidy are formed. Activities of NPOs and NGOs also serve in the market as a safety net.
- Such safety net does not exist outside the market, but rather functions to adjust and control the market economy.
- Mid-1980s: financial liberalization caused surplus money to flow into the land and housing market, causing the bubble economy and its collapse. Germany having strong city planning regulation, and introduction of interest tax could escape from the bubble.
- Even in the labor market, when unstable employment and non-regular employment increase without creating new employment rules, drastic consumption cannot be expected due to employment insecurity.
- Market economy is maintained by multiple feedback:
- The regulatory mechanism has been developed with great depression; Keynesian economics has justified abandonment of the gold standard, function of the central bank as the last resort, as well as agile interest rate policies, payoff schemes, and operation of the open market.
- To remove inefficient companies and banks from the market may cause side effects; if a company goes bankrupt without sufficient allowance for bad debts, the losses will affect the lending bank's capita. So-called credit crunches occur, further exacerbating the recession.
- It is possible to prevent sudden collapse of the financial system for the time being by such financial operations through public works investment, public funding, government bond buying by the central bank, etc., but these measures cannot restore the functioning of the market; instead slow panic will proceed.
- Simple privatization and deregulation policies will fail because which may break multiple feedback systems by replacing them with a single feedback function based on price as the single signal. Political democracy to keep the market being fair is also an important feedback function.
- >Top Transcriptome:
- If DNA is the design document for life, RNA is the purchase order, which corresponds to the accounting books of a company. The corporate audit cannot check all products (=proteins), so they check the accounting book (=RNA).
- Affymetrix, Inc. (now Applied Biosystems) developed GeneChip array , which is a method to measure how much RNA were made on the chip. This array is a chip attached 30,000 DNA sequences. By taking RNA from a sample such as white blood cells and measuring the amount of bound RNA, it is possible to know how much RNA of 30,000 genes were produced. Such RNA produced by activating a gene is called transcript. (Transciprtome) [Two techniques are used: DNA microarray and RNA-seq]
- Eg.: In the case of liver cancer, we can see the gene with increase of particular RNA. We can measure the protein increased in blood of the cancer patient; thus we can screen early cancer possibility with a single drop of blood. Making an antibody which recognizes and attack this protein will be an epoch-making therapeutic drug killing cancer cells.
- >Top Michael B. Eisen's Cluster Theory:
- A stimulus activated many genes over time (Gene cluster)
- Eg.: In the case of cholesterol cluster: There re proteins which control cholesterol levels, inducing genes involved in cholesterol synthesis. Cholesterol deficiency provides multiple feedback functions, whether it is synthesized, reduce in breakdown, or supply from the blood.
- The system becomes visible from the cluster:
- In developing a new anti-inflammatory drug, when a gene is activated, which produces a protein, then which activates the next gene group like a chain reaction. The effect of the anti-inflammatory agent is expected by adding a protein synthesis inhibitor which suppresses this chain reaction.
- As a result, it was found that this drug stopped the second stage inflammatory chain reaction, but rather strengthened the first stage reaction. In other words, this drug could be a new drug different from conventional steroid hormones, which suppress only chronic gene activation without suppressing the acute phase of inflammation.
- Until now, the development style has been drug →regulation of proteins involved in inflammation →activation of gene cluster in inflammation (Proactive systemology). However, through comprehensive analysis of heredity, it becomes possible to find a gene cluster changed by the addition of a drug → estimation of regulatory mechanism →protein on which the drug acts (Reverse systemology like development)
- Rather than one regulatory protein controls one gene, many proteins control many genes. By systematic analysis of the activation of entire genes, it is possible to infer which control system is now working. It is possible to raise prediction system by observing complex objects which basically cannot be observed, neither by models nor simulations, by intervening with paying attention to when and where occurs.
- Transplantation of institutions between different economic systems:
- The issue of introducing the global standard; in particular the regulation of capital adequacy ration of banks, international accounting standard, current value accounting, and obligation to disclose pension debt, etc.; which caused tremendous deflationary pressure on Japanese economy.
- Game theory is adopted in economics based-on non-cooperative games (Nash equilibrium); but which cannot adequately depict social symbiosis and income redistribution which are the elements of regulatory control mechanisms.
- While acknowledging that there is a limit of human economic rationality, we assume super-rational human beings; that is, each person pursues selfish purpose, which eventually leads to altruistic act by self=purposed acts to raise own reputation.
- The government is responsible for pensions and employment insurance schemes to avoid cream skimming due to asymmetric information.
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2.
制度の束と多重フィードバック:
- elucidate: make clear
- nematode: 線虫
- regulatory mechanism: 調節機構
- prognosis: an opinion of the likely course of a medical condtion; 予知, 予断
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- ヒトゲノム解読がもたらした生命観:
- 人間は約30億個のゲノムを持つ。
- 1990年代後半: セレーラ社 (クレイグベンター社長)は、ベンチャー市場から数百億円を集め、ヒトゲノムに解読競争の先頭に立った。
- ゲノムがわかれば人間の全てがわかると過大宣伝され研究費が集められた。
- しかし、ゲノム解読で明らかになった場合はDNA配列であり、これは生命原理の解明にはほど遠い。
- 遺伝子重複仮説:
- 個々の蛋白質情報をもっている遺伝子数は、大腸菌で4千、ネズミや人間で3万程度。
- 遺伝子数が増えるにつれて、前からある遺伝子と似た遺伝子が重複してくいる。(遺伝子重複)
- ハウスキーピング遺伝子: 家を維持するのの同様に生命の基本的な代謝や複製にかかわる6機能の遺伝子をいう。これは4〜6千あると推定される。これが二セットになったのが線虫で、四セットになったのが脊椎動物かも知れない。
- 遺伝子が重複していれば、片方に変異がおこっても問題ない。
- さらに、重複進化の場合は、複雑な新しい構造を作りやすいことになり、生物の進化のスピードも飛躍的に早くなる。
- 増加する調節領域:
- ヒトゲノムの場合、蛋白質の構造が書かれている領域は全体の約2%で、残りの多くはその蛋白質の利用を決める調節制御に関わる配列である。
- この調節制御によって環境変化に適応できる範囲がどんどん広がることである。(ネオダーウィニズムは、遺伝子が選択淘汰されるとした誤り)
- 例: 異常ヘモグロビンをもつ赤血球はマラリアの感染に抵抗力がある。(さまざまな環境変化に対し予め前適応している。)
- 逆遺伝学 (Reverse genetics):
- 従来は、生命の機能を担う蛋白質を同定して、その遺伝子を決めていた。機能→蛋白→遺伝子の順で研究する。(Forward genetics)
- 逆遺伝学は、遺伝性病気→蛋白→機能を解析する。
- 人間には3000種類を超える遺伝性の病気がある。
- 一個の遺伝子変化が病気を発現する場合はやりやすい。実際には複数の遺伝子が関与してことが多い。
- 例:動脈硬化の患者の場合は、コレステロールや血圧が高く、太っていて、喫煙者は動脈硬化の危険率は10倍以上になる。(リンケージ・スタディ)
- 但し、リンケージ・スタディは直接的な仮説を証明しないので、多くの人について統計的に調査する必要がある。 (メガ・スタディ)
- リンケージ・スタディにも限界がある。人間の免疫における個体識別をするHLA遺伝子群がる。このHLAが異なる相手と結婚した方が近親結婚を避けるのに都合がよいかということだがまだ結論をい出せるほどの確定的な調査ができていない。恋愛の遺伝子、同性愛の遺伝子の議論も同様の暴走と言える。
- 市場経済は調節制御と共に進化:
- 新古典派の一般均衡モデルは、複雑な非市場的制度をなるべく排除してできている。それはどの国や社会にも当てはまる普遍的なモデルとされてきた。
- しかし、事実はまったく異なる。むしろモデルから排除された非市場的諸制度が市場経済を制御している。(市場は制度の束)
- 資本主義市場経済は、それ以前の封建制度と違って、私的所有権、貸借関係が法的に保護された信用システムが発達して来た。しかし、市場経済の初期ほど、家族や共同体を不可欠の前提としていた。それらが失業者や高齢者のプールの機能を果たしてきた。
- 逆に言えば、市場が家族や共同体を解体していけばいくほど、市場はより複雑な調整制御の仕組みを必要をする。労働組合、失業保険、年金、健康保険などの社会保障制度がないと社会を維持できなくなる。
- さらに所得分配の悪化は、社会の治安を悪化させ、消費を減少させ不況を深刻化させる。税制や所得補助などさまざまな所得再分配制度が形成されてくる。NPOやNGOの活動もセーフティネットとして市場に参加してくる。
- セーフティネットは、市場の外部にあるのではなく、むしろ市場経済の調整制御の機能を担う。
- 1980年代半ば: 金融自由化によって余剰マネーが土地住宅市場に流れてバブル経済とその破綻を起こした。都市計画規制が強く、利子税導入が問題になったドイツでは例外的にバブルを免れた。
- 労働市場でも、新たな雇用ルールを作らないまま雇用リストラや非正規雇用を増加させると雇用不安から思い切った消費ができなくなる。
- 市場経済は多重フィードバックで維持:
- 大恐慌を景気として調節制御の仕組みが発達してくる。金本位制の放棄、最後の貸し手としての中央銀行、機動的な金利政策、ペイオフ制度、公開市場操作などを正当化してきたのがケインズ経済学である。
- 非効率な企業や銀行を市場から排除する課程では、副作用が起こる。十分な貸倒引当金を積まないままk魚が倒産すると損失が表面化して銀行の自己資本を蚕食する。いわゆる貸し渋りや貸し剥がしが起こり、不況をさらに悪化させる。
- 公共事業政策による景気対策、公的資金投入、日銀により国際買いオペなど多重うな調整制御によって当面の金融システム破綻を防ぐことはできるが、市場の機能を本格的に回復される訳ではない。代わりにスローパニック、ゆっくりとパニックが起きるようになる。
- 素朴な民営化や規制緩和政策は、多重なフィードバック制度を寸断して、価格をシグナルとする一つのフィードバック機能に置き換えようとするので失敗する。それを公正に保つ政治的民主主義も一つの重要なフィードバック機能である。
- トランスクリプトーム (Transcriptome):
- DNAが生命の設計書とすると、RNAは生命の注文書である。いわば企業の会計帳簿に匹敵する。企業監査は、製品(=蛋白質)の全てをチェックできないので、会計帳簿(=RNA)をチェックする。
- アフィメトリックス社: 半導体基板上にRNAがどれだけ作られたかを測定する方法を開発した。このDNAチップは、30,000のDNAの配列を貼り付けたチップである。白血球などのサンプルからRNAを取り出して結合した量を測定することで、30,000の遺伝子のRNAがどれだけ作られたがわかる。遺伝子が活性化されて作られるRNAはTranscriptという。(
Transcriptome)
- 例: 肝臓癌で最もRNAが増えている遺伝子がわかる。この蛋白の量を血液中で測定すると癌の患者で上昇するとで、癌の早期検診が血液1滴で可能となった。この蛋白を認識して攻撃する抗体を作るとがん細胞を殺す画期的な治療薬となる。
- M.B.アイゼンのクラスター論:
- ある刺激を与えると、時間とともに沢山の遺伝子が活性化される。(遺伝子クラスター)
- 例: コレステロールクラスター: コレステロール濃度を管理する蛋白があり、それによってコレステロール合成に関わる遺伝子が誘導される。コレステロールが不足すると、合成するのか、分解を減らすのか、血液中から取り込むのかの多重的なフィードバック機能が行われる。
- クラスターからシステムが見える:
- 新しい炎症を抑える薬のメカニズムに関して、遺伝子が活性化されると蛋白が作られて、これが連鎖的に次の遺伝子群を活性化する。この連鎖反応を抑える蛋白合成阻害剤を加えて、抗炎症剤の効果を見た。
- その結果、この薬は、炎症の連鎖反応の第二弾会は止めるが、第一段階の反応はむしろさらに強化していまうことがわかった。つまりこの薬は、炎症の急性期は抑えないで、慢性の遺伝子活性化だけを抑えるステロイドホルモンとは異なる新薬であった。
- いままでの開発スタイルは、薬→炎症に関わる蛋白の調整→炎症での遺伝子クラスターの活性化 (前向きシステム学) だった。だが、遺伝に発現が網羅的に解析されると、薬を加えて変化する遺伝子クラスター→調節制御の推定→薬の作用する蛋白というような逆システム学的な開発が可能となる。
- 一つの制御蛋白が一つの遺伝子を制御するのではなく、数多くの蛋白が沢山の遺伝子を制御している。遺伝子全体の活性化の様子を系統的に解析すると、どの制御系が働いているかを推測することが可能となる。いわば観察不可能な複雑な対象に、モデルやシミュレーションではなく、何らかの介入することでいつどこでに注目しながら観察することで予測の制度を上げることができる。
- 異なる経済システム間の制度移植:
- グローバルスタンダード導入問題: 特に、銀行の自己資本比率規制、国際会計基準採用、時価会計、年金債務の開示義務などは、日本経済に猛烈なデフレ圧力をもたらした。
- 今日、経済学で採用されているゲーム理論は、非協力ゲーム(ナッシュ均衡)を基盤としているが、調節制御の要素である共生や所得の再分配を十分に描けていない。
- 人間の経済合理性には限界があることを認めながらも、超合理的な人間を想定している。(各人の利己目的追求が評判を上げるという自己目的行為によって利他的行為につながる。)
- 政府が年金や雇用保険のを担うのは、情報を非対称によるクリームスキミングを避けるため。
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